2000年10月，重大校〔2000〕255号文批准成立重庆大学期刊社。2001年1月17日，原重庆大学、重庆建筑大学、重庆建筑高等专科学校各期刊编辑部合并，正式组建重庆大学期刊社。学校对期刊实行统一归口管理，由一名校领导分管期刊工作。2006年4月期刊社推进集中管理运行机制改革，对人、财、物实行全面综合管理，降低运行成本，提高办刊效益。2007年10月期刊社将分散在三个校区的各编辑部办公室统一搬迁至新办公场地，实现学校承办的5种期刊编辑部集中统一办公。

期刊社是集期刊管理和出版于一体的学校直属二级单位，现管理20种学术期刊，其中直接承办《重庆大学学报》《重庆大学学报（社会科学版）》《纳米材料科学（英文）》《土木与环境工程学报（中英文）》《高等建筑教育》5种期刊，并对由学院（平台）、附属医院承办的《镁合金学报（英文）》《地下空间与工程学报》《西部人居环境学刊》《中国药房》《钢铁钒钛》《中国医院用药评价与分析》《自动化与人工智能（英文）》《智能肿瘤学（英文）》《生物岩土技术（英文）》《低碳科学（英文）》《空间电力与无线电传输（英文）》《地球能源科学（英文）》《数字语言文学研究（英文）》《太空宜居性研究(英文)》《植物激素（ 英文）》进行业务指导。

长期以来，重庆大学高度重视期刊建设和发展工作，在“十四五”期间制定《重庆大学关于加强高水平学术期刊建设的意见》《重庆大学高水平学术期刊培育资助计划实施办法》系列文件，将学术期刊发展规划纳入学校发展总体规划和“双一流”建设总体方案，推进一流学术期刊建设。

目前学校主办的学术期刊中2种入选SCIE/ESCI数据库、6种CSCD核心、1种CSSCI核心、7种北大中文核心、1种入选中国科技期刊卓越行动计划领军期刊、2种入选中国科技期刊卓越行动计划高起点新刊。

重庆大学期刊社始终坚持正确的办刊方向和办刊宗旨，以建设世界一流期刊为目标，树立“以质量求生存，以特色求发展，以创新求突破，以融合求变革”的办刊理念和“目标牵引入主流，集中力量办大事，多元文化多包容，和谐氛围聚人心”的工作理念，遵循“发展问题统筹考虑，重点工作有所突破，常规工作稳步推进”的工作思路，着力期刊的国际化、专业化、数字化、集约化、品牌化建设，全面增强期刊的国际竞争力、学术传播力和社会影响力，充分发挥期刊在推进学术建设、促进学科发展、服务创新体系建设中的重要作用，为提高学校人才培养质量和科学研究水平，实现学校“双一流”建设发展目标做出应有的贡献。